Fatti
L'Ufficio federale delle costruzioni e della logistica (UFCL) ha indetto il 8 aprile 2005 una gara d'appalto pubblica in procedura aperta per un ampio progetto informatico dell'Amministrazione federale delle contribuzioni e ha aggiudicato il contratto alla società X AG il 20 marzo 2006. Dopo che i negoziati contrattuali prolungati non hanno portato a una conclusione con questo offerente, l'UFCL ha revocato l'aggiudicazione con decisione del 28 agosto 2007 e ha pubblicato un giorno dopo, il 29 agosto 2007, l'interruzione della procedura di appalto.
Contro entrambi i provvedimenti, la società X AG ha presentato ricorso al Tribunale amministrativo federale il 14 settembre 2007. Nel procedimento relativo alla revoca dell'aggiudicazione, ha chiesto l'annullamento della decisione del 28 agosto 2007 e l'accertamento dell'illegittimità di tale decisione, eventualmente delle azioni dell'ente aggiudicatore; inoltre, dovrebbe essere concesso l'effetto sospensivo del ricorso e l'ente aggiudicatore dovrebbe essere diffidato dall'intraprendere qualsiasi misura esecutiva con un terzo, in particolare la conclusione di un contratto con un terzo nonché l'avvio di una nuova procedura di appalto e/o l'aggiudicazione a un terzo, riguardo all'oggetto dell'appalto in questione. La ricorrente ha presentato richieste analoghe anche in relazione alla decisione di interruzione.
Con decisione incidentale del 30 gennaio 2008, il Tribunale amministrativo federale ha riunito i due procedimenti e ha respinto le richieste (inizialmente concesse in via provvisoria) della ricorrente di concessione dell'effetto sospensivo.
Legge
Il Tribunale federale ha esaminato innanzitutto l'ammissibilità del ricorso in materia di diritto pubblico contro la decisione incidentale del Tribunale amministrativo federale. È giunto alla conclusione che i presupposti per il ricorso sono soddisfatti, in quanto si tratta di una questione giuridica di importanza fondamentale e alla ricorrente minaccia un pregiudizio giuridico irreparabile.
Nel merito, il Tribunale federale ha confermato l'opinione del Tribunale amministrativo federale. L'ente aggiudicatore può…