Fatti
La società A. GmbH (di seguito: il contribuente) è stata fondata il 26 settembre 2007 e ha sede a U./GR. È iscritta nel registro dei contribuenti interni tenuto dall'Amministrazione federale delle contribuzioni (AFC) e contabilizza secondo il metodo effettivo. Nei periodi fiscali dal 2013 al 2017, il modello di business consisteva nel fatto che il contribuente acquistava legname in piedi ("in pianta") da vari proprietari forestali (di seguito: produttori primari) per rivenderlo, dopo l'abbattimento, a segherie in Svizzera o all'estero. Per effettuare i lavori di abbattimento, assumeva a proprio nome i subappaltatori necessari (di seguito: imprese forestali), che compensava a proprie spese, sostenendo così i costi di produzione. Dal prezzo del legname da pagare ai produttori primari, detraeva i costi di produzione e un margine ("deduzione di coordinamento").
L'AFC ha controllato il contribuente e ha constatato che quest'ultimo aveva addebitato integralmente ai produttori primari i costi di produzione di Fr. 5'304'357.- e, inoltre, aveva applicato il margine ("deduzione di coordinamento"). Aveva addebitato i costi di produzione alla voce di spesa 3060, ma aveva accreditato lo stesso importo alla voce di ricavo 4500. Inoltre, non aveva assoggettato ad imposta né l'addebito dei costi di produzione né l'applicazione della "deduzione di coordinamento", partendo dal presupposto di una prestazione (fornitura di legname da parte dei produttori primari al contribuente). Secondo l'AFC, si trattava in realtà di due prestazioni.
Legge
Il Tribunale federale afferma che l'addebito dei costi di produzione effettivi da parte del contribuente ai produttori primari non costituisce una riduzione…