Fatti
Il ricorrente [X.] gestisce un impianto automatico di protezione degli uccelli nella proprietà vinicola Hörnli a Endingen. Il convenuto [Y.] presentò il 2 settembre 2005 una richiesta al Consiglio comunale di Endingen per avviare un procedimento di autorizzazione edilizia ordinaria per l'impianto. Il Consiglio comunale negò l'obbligo di autorizzazione edilizia il 17 ottobre 2005. Un ricorso amministrativo presentato da [Y.] contro questa decisione fu accolto dal Dipartimento delle costruzioni, dei trasporti e dell'ambiente (BVU) il 2 maggio 2006 e la questione fu rinviata al Consiglio comunale. Contro questa decisione, [X.] presentò un ricorso al Tribunale amministrativo, che fu respinto dal Tribunale amministrativo del Canton Argovia il 16 marzo 2007.
[X.] presentò quindi un ricorso in materia di diritto pubblico (art. 82 e segg. LTF) e chiese che al ricorso fosse concessa la sospensiva. Il Presidente della I sezione di diritto pubblico del Tribunale federale respinse la richiesta di concessione della sospensiva il 29 giugno 2007.
Legge
Il Tribunale federale esaminò le condizioni di ammissibilità e stabilì che la legge sul Tribunale federale è applicabile, poiché la decisione impugnata è stata emessa dopo il 1° gennaio 2007. Il Tribunale amministrativo aveva affermato l'obbligo di autorizzazione edilizia per l'impianto di protezione degli uccelli e aveva rinviato la questione al Consiglio comunale per avviare un procedimento di autorizzazione edilizia ordinaria.
Il Tribunale federale ritenne che le condizioni dell'art. 93 cpv. 1 lett. b LTF siano state soddisfatte, poiché l'accoglimento del ricorso avrebbe immediatamente portato a una decisione finale e quindi avrebbe evitato un notevole dispendio di tempo o di costi per un lungo procedimento di prova. Il ricorrente era legittimato a presentare il ricorso e il ricorso era stato presentato tempestivamente.
Il Tribunale federale respinse l'obiezione del ricorrente, secondo cui il Tribunale amministrativo aveva violato il diritto di essere ascoltato, rinunciando a un…