Fatti

Il 11 maggio 2012, X. ha presentato alla Comune di Savognin una richiesta per la costruzione di un nuovo edificio residenziale plurifamiliare. La Helvetia Nostra ha presentato un'opposizione contro il progetto edilizio e ha richiesto il rifiuto dell'autorizzazione edilizia. La Comune di Savognin ha respinto l'opposizione e ha rilasciato l'autorizzazione edilizia.

Il 25 giugno 2012, Y. ha presentato alla Comune di Disentis/Mustér una richiesta edilizia per la costruzione di un nuovo edificio residenziale plurifamiliare. La Helvetia Nostra ha presentato un'opposizione contro il progetto edilizio. Il Consiglio comunale di Disentis/Mustér ha respinto l'opposizione e ha rilasciato l'autorizzazione edilizia.

Contro le decisioni dei Comuni di Savognin e Disentis/Mustér, la Helvetia Nostra ha presentato un ricorso al Tribunale amministrativo del Cantone dei Grigioni. Il Tribunale amministrativo ha negato la legittimazione della Helvetia Nostra a ricorrere e non è entrato nel merito dei ricorsi.

Contro le sentenze del Tribunale amministrativo, la Helvetia Nostra ha presentato un ricorso in materia di diritto pubblico al Tribunale federale.

Legge

Il Tribunale federale ha innanzitutto constatato che la Helvetia Nostra rientra tra le organizzazioni legittimate a ricorrere ai sensi dell'art. 12 cpv. 1 lett. b LPN nel settore della protezione della natura e del paesaggio. Tuttavia, il ricorso di associazione ai sensi dell'art. 12 LPN è ammissibile solo nella misura in cui la decisione impugnata riguardi l'adempimento di un compito federale ai sensi dell'art. 78 cpv. 2 Cost. e dell'art. 2 LPN.

Il Tribunale federale…