En Fait
Y. SA est une société anonyme inscrite au registre du commerce du canton de Neuchâtel depuis 1955. Elle a pour but l'exploitation et la mise en gérance d'immeubles. En 2006, le Service cantonal des contributions a notifié à Y. SA les taxations relatives à l'année fiscale 2004, tant pour les impôts cantonal et communal que pour l'impôt fédéral direct. Le bénéfice imposable retenu s'élevait à 21'800 francs, après reprise à hauteur de 11'150 francs sur le montant de 21'150 francs déclarés par Y. SA à titre de salaire et autres frais versés à A., l'unique administrateur et actionnaire de la société.
Les décisions de taxation ont été confirmées par le Tribunal fiscal de Neuchâtel et le Tribunal administratif du canton de Neuchâtel. Y. SA a alors recouru au Tribunal fédéral.
En Droit
Le Tribunal fédéral a rejeté le recours dans sa mesure de recevabilité. Il a considéré que lorsque l'autorité cantonale de dernière instance rend une seule décision valant pour l'impôt fédéral direct et les impôts cantonaux et communaux, et que la question juridique est réglée de la même façon en droit fédéral et en droit cantonal harmonisé, le recourant peut attaquer cette décision dans un seul recours. Il n'est plus nécessaire d'exiger le dépôt de deux recours distincts, comme cela était le cas auparavant.
En l'espèce, la décision attaquée ne distinguait pas, dans son dispositif, l'impôt fédéral direct des impôts cantonaux et communaux. Cependant, la motivation indiquait que la notion de bénéfice net, servant de base à l'imposition des personnes morales et faisant partie du domaine…