En Fait
La société [X. GmbH] , dont le siège est à [A.] ZG, est majoritairement contrôlée par son administrateur [Y.] , dont le domicile est à [B.] ZH. L'administration cantonale des impôts de Zurich a revendiqué, par décision du 7 décembre 2007, la compétence fiscale à compter de la période 2002 à l'égard de la société, car sa direction et sa gestion effectives étaient exercées par l'administrateur à son domicile. Le Tribunal administratif du canton de Zurich a confirmé cette décision le 18 mars 2009 en dernier ressort cantonal.
La société [X. GmbH] a déposé un recours en matière de droit public auprès du Tribunal fédéral et demande principalement l'annulation de la décision du tribunal administratif. L'administration cantonale des impôts de Zurich et le Tribunal administratif du canton de Zurich concluent au rejet du recours.
En Droit
Le Tribunal fédéral a déclaré le recours en matière de droit public recevable et a reconnu la recourante comme légitimée à contester la décision de l'autorité inférieure. Dans le conflit de compétence intercantonale à trancher, les taxation already passées en force de chose jugée du canton de Zoug pour les périodes fiscales à partir de 2002 peuvent être attaquées.
Le Tribunal fédéral a constaté que la gestion effective de la société [X. GmbH] est exercée dans le canton de Zurich et que le canton de Zurich a donc revendiqué à juste titre la compétence fiscale à l'égard de la société. La recourante a fait valoir que le canton de Zurich avait perdu son droit de taxation pour les périodes 2002 à 2006, car il ne l'avait exercé qu'en 2007. Cependant, le…